教育部一共進(jìn)行過3輪學(xué)科評估，本文排名為第三輪評估的結(jié)果。在工商管理學(xué)科方面，西安交通大學(xué)與中國人民大學(xué)得分相同，應(yīng)為并列第一。其他部分學(xué)科也存在某些高校得分相同，全國排名并列第一的情況。
在有關(guān)部門的支持下，教育部學(xué)位與研究生教育發(fā)展中心（簡稱：學(xué)位中心）按照教育部和國務(wù)院學(xué)位委員會(huì)頒布的《學(xué)位授予和人才培養(yǎng)學(xué)科目錄》，對具有研究生培養(yǎng)和學(xué)位授予資格的一級學(xué)科進(jìn)行整體水平評估（簡稱：學(xué)科評估），并根據(jù)評估結(jié)果進(jìn)行聚類排位。此項(xiàng)工作于2002年首次在全國開展，至今已完成三輪評估。
第一輪評估于2002-2004年分3次進(jìn)行（每次評估部分學(xué)科），共有229個(gè)單位的1366個(gè)學(xué)科申請參評。第二輪評估于2006-2008年分2次進(jìn)行，共有331個(gè)單位的2369個(gè)學(xué)科申請參評。第三輪評估在95個(gè)一級學(xué)科中進(jìn)行（不含軍事學(xué)門類），共有391個(gè)單位的4235個(gè)學(xué)科申請參評，比第二輪增長79%。
第三輪學(xué)科評估歷時(shí)一年，按照自愿申請參評的原則，采用客觀評價(jià)與主觀評價(jià)相結(jié)合的方式，所需數(shù)據(jù)由相關(guān)政府部門、社會(huì)組織公布的公共數(shù)據(jù)和參評單位報(bào)送的材料構(gòu)成。通過對相關(guān)數(shù)據(jù)的公示、核查，同時(shí)還邀請了學(xué)科專家、政府部門及企業(yè)界人士進(jìn)行主觀評價(jià)，在此基礎(chǔ)上形成最終評價(jià)結(jié)果。
本文為第三輪評估結(jié)果：
北京大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（16個(gè)）：
哲學(xué)
政治學(xué)
中國語言文學(xué)
外國語言文學(xué)
考古學(xué)
中國史
世界史
數(shù)學(xué)
物理學(xué)
化學(xué)
地球物理學(xué)
力學(xué)
基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)
藥學(xué)護(hù)理學(xué)
藝術(shù)學(xué)理論
清華大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（13個(gè)）：
力學(xué)
材料科學(xué)與工程
動(dòng)力工程及工程熱物理
電氣工程
控制科學(xué)與工程
計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)
建筑學(xué)
核科學(xué)與技術(shù)
環(huán)境科學(xué)與工程
城鄉(xiāng)規(guī)劃學(xué)
軟件工程
管理科學(xué)與工程
設(shè)計(jì)學(xué)
清華大學(xué)-北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院（清華大學(xué)醫(yī)學(xué)部）
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
生物學(xué)
說明：結(jié)果顯示“生物學(xué)”排名第一的學(xué)校名稱為“清華大學(xué)-北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院（清華大學(xué)醫(yī)學(xué)部）”，與“清華大學(xué)”的學(xué)校代碼均為“10003”。
中國人民大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（9個(gè)）：
理論經(jīng)濟(jì)學(xué)
應(yīng)用經(jīng)濟(jì)學(xué)
法學(xué)
政治學(xué)
社會(huì)學(xué)
新聞傳播學(xué)
統(tǒng)計(jì)學(xué)
工商管理
公共管理
中國農(nóng)業(yè)大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（6個(gè)）：
農(nóng)業(yè)工程
作物學(xué)
農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境
植物保護(hù)
畜牧學(xué)
獸醫(yī)學(xué)
北京師范大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（5個(gè)）：
教育學(xué)
心理學(xué)
中國史
地理學(xué)
生態(tài)學(xué)
武漢大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（4個(gè)）：
馬克思主義理論
地球物理學(xué)
測繪科學(xué)與技術(shù)
圖書情報(bào)與檔案管理
上海交通大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（3個(gè)）：
機(jī)械工程
船舶與海洋工程
臨床醫(yī)學(xué)
南京大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（3個(gè)）：
物理學(xué)
天文學(xué)
地質(zhì)學(xué)
華中科技大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（3個(gè)）：
機(jī)械工程
光學(xué)工程
公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)
東南大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（3個(gè)）：
交通運(yùn)輸工程
藝術(shù)學(xué)理論
生物醫(yī)學(xué)工程
中國礦業(yè)大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（2個(gè)）：
礦業(yè)工程
安全科學(xué)與工程
中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（2個(gè)）：
物理學(xué)
地球物理學(xué)
中國海洋大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（2個(gè)）：
海洋科學(xué)
水產(chǎn)
中國地質(zhì)大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（2個(gè)）：
地質(zhì)學(xué)
地質(zhì)資源與地質(zhì)工程
中國傳媒大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（2個(gè)）：
新聞傳播學(xué)
戲劇與影視學(xué)
浙江大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（2個(gè)）：
光學(xué)工程
農(nóng)林經(jīng)濟(jì)管理
北京中醫(yī)藥大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（2個(gè)）：
中醫(yī)學(xué)
中西醫(yī)結(jié)合
北京林業(yè)大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（2個(gè)）：
風(fēng)景園林學(xué)
林學(xué)
北京航空航天大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（2個(gè)）：
航空宇航科學(xué)與技術(shù)
儀器科學(xué)與技術(shù)
西安交通大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
工商管理
西南交通大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
交通運(yùn)輸工程
國防科學(xué)技術(shù)大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
軟件工程
中央音樂學(xué)院
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
音樂與舞蹈學(xué)
中央民族大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
民族學(xué)
中央美術(shù)學(xué)院
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
美術(shù)學(xué)
中山大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
生態(tài)學(xué)
中南大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
冶金工程
中國石油大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
石油與天然氣工程
同濟(jì)大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
土木工程
天津大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
化學(xué)工程與技術(shù)
四川大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
口腔醫(yī)學(xué)
上海中醫(yī)藥大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
中藥學(xué)
南京信息工程大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
大氣科學(xué)
南京農(nóng)業(yè)大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境
南京理工大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
兵器科學(xué)與技術(shù)
蘭州大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
草學(xué)
江南大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
食品科學(xué)與工程
華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
園藝學(xué)
華南理工大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
輕工技術(shù)與工程
河海大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
水利工程
哈爾濱工業(yè)大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
力學(xué)
復(fù)旦大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
政治學(xué)
東華大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
紡織科學(xué)與工程
東北林業(yè)大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
林業(yè)工程
電子科技大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
電子科學(xué)與技術(shù)
北京郵電大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
信息與通信工程
北京體育大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
體育學(xué)
北京理工大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
兵器科學(xué)與技術(shù)
北京科技大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
科學(xué)技術(shù)史
北京交通大學(xué)
全國排名第1的學(xué)科（1個(gè)）：
系統(tǒng)科學(xué)
